兒童敗血症是一種感染性疾病，只要應用有效抗生素可以完全控制治療。在診斷敗血症以後如果在血培養結果或病原菌不明確情況下，一般是經驗性應用抗生素。應用抗生素以後要看臨床症狀是否好轉，也就是看感染表現和炎症反應表現有沒有好轉。如果見效說明應用藥物有效。最終治療藥物的選擇是依據細菌學、病原學檢測，根據藥敏試驗選擇敏感抗生素。

敗血症抗感染治療是治療重點，抗感染治療強調要早期儘早開始，所以在血培養結果沒有出來之前，要根據經驗應用可能有效的抗生素。抗生素藥物劑量一定要足；聯合應用，可以用一種或兩種，甚至三種有效殺菌藥物聯合應用；一旦發展到敗血症，一般提示疾病感染比較嚴重，所以這時需要進行靜脈抗生素應用；抗生素應用療程一定要足。遵循這些原則，敗血症可以得到很好的控制。