腳趾頭骨髓炎的治療主要包括保守治療和手術治療。

由於外傷或手術等原因引起的腳趾頭急性骨髓炎，要注意患肢的制動減少活動。還要採用針對性的抗生素進行保守治療，主要用對金黃色葡萄球菌或溶血性鏈球菌敏感的青黴素類或者頭孢類的抗生素，靜脈輸入進行治療。比如氨苄西林、頭孢呋辛。必要時可以配合抗厭氧菌的藥物進行治療，比如甲硝唑，也可以同時採用中藥進行局部的外敷治療。

如果局部有明顯的膿腫形成，需要通過手術切開引流，並注意定時換藥，有助於炎症的控制。對於上述保守治療效果不理想，需要考慮通過手術進行截趾。