胎停育清宮的最佳時間是患者一旦發現胎停育，應該積極就診，儘早行清宮手術，避免對後續生育造成更大的影響。通常患者發現胎停育時，胚胎停止發育已經有一段時間，停止發育的胚胎在體內如果沒有自行排出，胚胎組織可能壞死、機化。

胚胎壞死的過程中，可能釋放大量凝血因子，導致患者凝血功能障礙，可能存在出血等表現而增加感染風險。胚胎機化過程中，與子宮宮壁、子宮內膜附著更為牢固，會增加清宮手術的風險，導致清宮手術中子宮穿孔、出血，以及無法完全清除的風險增加，可能會影響患者下一次懷孕。

部分患者發現胎停育後不願進行清宮手術，雖然胚胎可能自然排出，但是醫生建議不應等待過長時間。如果患者發現胎停育時，胚胎與正常孕周相比無明顯差別，可以等待1周，如果胚胎無法自然排出，患者需要通過清宮手術進行治療。如果患者發現胎停育時，孕囊和胚胎大小和實際孕周相差2周以上，證明胚胎停育已經存在一段時間，這時患者需要積極進行處理，避免對後續再次懷孕造成更大影響。