慢性胰腺炎主要包括四方面的臨床症狀，即腹痛、內分泌功能障礙、外分泌功能障礙、胰腺周圍的局部併發症。慢性胰腺炎患者的腹痛和急性胰腺炎患者可能不完全一樣，平時是間斷髮作中上腹的疼痛，但是也可以出現急性發作，這種情況下與急性胰腺炎患者腹痛的發作和性質相似。在腹痛的基礎之上，慢性胰腺炎與急性胰腺炎的很重要的區別之一是慢性胰腺炎患者存在內外分泌功能的障礙。內分泌系統功能障礙主要是胰腺內分泌功能萎縮以後不能分泌足夠的胰島素滿足機體需要，患者出現頑固性高血糖或者稱為醫源性糖尿病。外分泌功能障礙主要是胰腺的外分泌功能受到影響，或者胰腺本身萎縮以後不能分泌足夠的消化酶來消化進食的蛋白質和脂肪，患者會出現脂肪瀉。慢性胰腺炎患者可以出現局部的併發症，比如胰管擴張、胰管結石、腺泡萎縮、胰腺假性囊腫，這種情況下可能會對胰腺本身以及胰腺周圍的臟器，如胃等造成壓迫的症狀，CT上有相應的表現。