懷孕13周進行人工流產較為困難，需要先用藥物方式幫助胎物從體內排出，根據B超判斷是否有胎物殘留，再決定是否需要清宮手術。懷孕13周已經進入中孕期，早孕在12周前，進行人流手術需在懷孕70天內，即在孕10周內，懷孕10周以上人流手術較困難，因為胎兒已經較大，且此時胎兒還沒有進入到成熟階段，宮頸宮頸亦沒有成熟，屬於緊閉的狀況，需要宮頸成熟後胎兒才能娩出。

如果胎兒較大，則不能同早期流產一樣通過負壓吸引的方式吸引出來。所以懷孕13周時需要給予一定的藥物，如米非司酮類的藥物，幫助胎盤從子宮壁剝離，幫助宮頸口擴張以及胎物從宮腔內排出。

因為13周時胎盤已經和子宮壁聯繫得比較緊密，排出後需要再次複查B超，瞭解是否有胎物殘留。如果有胎物殘留，可能還需要進行清宮手術，將殘留胎盤組織再次清除到體外。所以懷孕13周進行流產需要住院，在有輸液、輸血的條件下，才能採用口服藥物的方式幫助胎物排出，再採用清宮方式處理胎物殘留。