通過體格檢查可以查出卵巢癌，但有一定難度。卵巢是長在盆腔內部、深部，一般的婦科檢查不容易發現，甚至做B超也可能發現不了，特別是早期的卵巢癌。早期卵巢癌血液中的腫瘤標誌物可能完全正常，因此如果進行體檢，可能會漏掉非常早期的卵巢癌。

如果一旦發現有卵巢囊腫，且囊腫內又存在實性部分，或有乳頭結構，此時應非常警惕卵巢囊腫是否有交際性腫瘤，或惡性腫瘤的情況。部分情況下的體檢，比如做PET-CT檢查或CT檢查、核磁檢查等，能夠提高診斷的檢出率。

另外，腫瘤標誌物的檢查也是一項非常重要的檢查，只有在超出正常值很多時才有診斷意義。但由於部分良性腫瘤或炎症也可能導致腫瘤標誌物增加，因此如果腫瘤標誌物單純增高一點，也不要過度憂慮，要綜合評價所有的檢查情況，來判斷是否是卵巢癌。