通常卵巢早衰與多囊(多囊卵巢綜合徵)不會並存，兩者在卵巢功能反應上是截然不同的兩種反應，卵巢儲備也不一樣，主要有以下區別：

1、卵巢早衰：常表現為閉經，檢查激素時可發現促卵泡激素(FSH)較高，隨機間隔6周左右複查FSH，均＞40IU/L。通常雌激素較低，＜20pmol/l，因卵巢表面已沒有卵泡，無法提供雌激素。檢查抗繆勒管激素(AMH)為0.01ng/ml或0.02ng/ml，基本接近於0。B超發現卵巢較小，表面基本看不到竇卵泡，且由於雌激素較低，內膜呈線狀，較薄；

2、多囊：也可出現閉經，但通常雌激素不＜20pmol/l，且卵泡較多，雌激素可能＞80-100pmol/l。FSH不會＞40IU/L，且促黃體生成素(LH)較高。如果合併雄激素水平過高，則AMH值可＞3ng/ml，甚至＞8ng/ml，因此多囊與卵巢早衰的激素水平相比正好相反。B超發現卵巢體積增大，可觀察到許多竇卵泡，一側或雙側可＞12個竇卵泡數。