急性咽炎和扁桃體炎的區別有以下：

1、病因上，兩者都有病毒、細菌感染的可能，但是急性咽炎尤其是急性水腫性咽炎，是由於變態反應（過敏反應）所誘發導致的，扁桃體沒有。

2、症狀上還是有區別的，急性咽炎的症狀總體沒有扁桃體炎那麼嚴重，疼痛沒有扁桃體炎那麼劇烈，當然個別情況下，有的患者比如是急性壞死性咽炎，疼痛也非常明顯，但這種疾病已經非常少見了。

3、查體上有區別，急性咽炎主要是表現為咽部，比如前弓、咽後壁、咽峽部等部位的充血以及炎症改變，扁桃體炎主要病變在扁桃體，扁桃體充血、腫大以及扁桃體表面有膿栓形成等相關性改變。

4、治療上還有區別，急性咽炎需要進行抗病毒治療，如果有細菌感染，也需要進行抗炎治療，急性扁桃體炎大多數首選進行抗生素抗炎治療。