因卵巢功能早衰發病機制尚不明確，目前尚無有效方法恢復卵巢功能。治療主要是通過激素補充，緩解低雌激素的症狀，預防心血管疾病和骨質疏鬆發生。對於是否有生育要求，治療區別如下：

1、無生育要求：由於部分診斷為早發性卵巢功能減退的患者，仍有懷孕的機會，所以需要做避孕措施。可以考慮人工週期輔助宮內節育器等避孕措施，或口服短效避孕藥；

2、有生育需求：應使用天然雌激素和孕激素補充治療。對於卵巢功能減退者，應積極輔助生殖技術助孕。對於不願使用激素或者有激素禁忌症的患者，則可以選擇植物類藥物、中醫藥等進行治療。