如果卵巢早衰徹底到了圍絕經期的狀態，卵巢分泌的雌激素和孕激素，甚至卵巢分泌雄激素的水平都會下降，會對性生活有一定的影響。雄激素控制性欲，在女性卵巢也會分泌少量的雄激素。卵巢功能衰竭了以後，所有的激素水平分泌都會下降，雄激素也會下降，所以慾望會降低。

由於雌激素、孕激素分泌的減少，可能會出現陰道的乾澀，可能在性生活的時候會有不適的感覺。陰道乾澀所以會有同房困難、同房不適，降低同房的質量。所以卵巢早衰肯定會對性生活有影響。但是也可以做激素替代，因為卵巢早衰不光是對這一方面有影響，實際上對女性患者所有的身體機能，包括心腦血管、骨質疏鬆、情緒都會有影響。所以在沒有禁忌症的情況下，考慮做全身的激素替代，來恢復或者彌補由於激素水平下降對身體造成的不適。