習慣性流產主要發病因素是胚胎染色體異常，胚胎染色體來自於父母，若出現異常，易遺傳給胎兒，導致習慣性流產，需通過靜脈採血檢查父母染色體；另外胚胎在發育過程中易出現基因改變，也會導致流產，若胚胎70天內停育，可取其新鮮絨毛做染色體檢查，為有創傷檢查，也存在流產風險；父母應進行孕前檢查，胚胎染色體應在懷孕以後檢查，或者是胚胎停育以後再做檢查，以免再發生流產。