潰瘍性結腸炎目前發病機理尚不明確，臨床治療相對棘手，多采取規範化綜合治療方式。治療方法如下：

1、中藥治療：不同臨床病症、採用個體化治療，如脾腎陽虛者，採用溫腎健脾、澀腸止瀉藥物。大腸溼熱者，採用清熱利溼、清熱解毒止瀉藥物，大多數患者的臨床症狀可以得到緩解；

2、中藥保留灌腸：藥物直接作用於病變的直腸、乙狀結腸，促進結腸黏膜炎症修復、潰瘍修復，緩解臨床症狀；

3、西藥治療：首選藥物為美沙拉嗪，服藥期間定期複查肝腎功能，重症或爆發性患者採用激素治療、免疫製劑治療、生物製劑治療。