如果患者結核性腹膜炎發現較早，進行積極有效的治療，並且堅持足夠療程，儘早引流腹水，一般結核性腹膜炎能夠根治。

但是，臨床較多結核性腹膜炎患者就診時病程已經較長，甚至並非因結核性腹膜炎就診，而是繼發腸梗阻才就診。此時已經發生很多器質性病變，腸道已嚴重粘連，即使療程達到12-15個月，也可能留下較多後遺症。