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精液檢查需要注意禁慾時間，一般是禁慾2-7天，但是一般都會建議4-5天，這時精子質量為最佳狀態。禁慾時間過長，容易導致精子成活率下降；如果禁慾時間過短則容易導致精子密度下降。檢查精液時，最好是在醫院取精室，如果不能自行取精，則需要在30分鐘之內將精液送到 實驗室，避免精液汙染，採用專門的採精設備，不能應用避孕套，因為避孕套內含有殺菌的物質。取精液時，儘量將精液全部取到取精杯內，避免灑落在外面，灑落在外面可能影響精子的檢測結果。
精液分析標準對於形態這一項比較嚴格，是由人工技術參與分析。根據世界衛生組織第五版要求，只要正常形態達到4%為正常，所以很多患者並不理解。精子質量畸形率與胎兒畸形是完全不同的概念。正常情況下，大部分精子都是畸形的，但是會有正常精子優先與卵子結合，可不必擔心。 現在多數醫院的檢查，顯示精子正常形態達到30%-40%，網上也存在很多這樣的數據，此類報告都是電腦自動分析的，不是人為判斷，計算機分析存在一定侷限性，不能智能判斷精子是否真的是畸形。所以現在是以4%為正常標準。
精子畸形率高，現在按照國際衛生組織（WTO）第5版的精液化驗指標，規定正常精子的形態只要達到4%，就認為這份精液是正常的。所以在精液中看到畸形精子，潤頭部畸形、尾部畸形、頸部畸形精子是大量存在的，不可能個個精子都是好精子，只要達到一定的正常數量就不會影響懷孕。只有好的精子、不畸形的精子才有可能有力氣鑽到卵子中，這是一個物競天擇，也是一個自然選擇。為什麼說自然懷孕比試管嬰兒要好，就是因為它經過自然的選擇，只有最強的精子才能鑽到卵子中去。當然了，如果說他的正常精子形態比4%還少，只有1%-2%，這個時候就要做治療了。
精子液化時間長首先要區分是真的液化時間長還是假的液化時間長。精液的液化時間，正常自然狀態是在女性陰道內液化，女性陰道是相對比較溫暖潮溼的一個環境。現在國內的多數男科實驗室並沒有模擬這種溫暖潮溼的環境，以評判精液的液化時間。正常的情況下，檢測是要放在溫箱 內，或者放在一定的恆溫板上，使精液在相對比較穩定的溫度下液化。如果真的是液化時間較長，考慮前列腺或附睪出現問題，也即是精液液化和凝固的因子不能達到平衡狀態，從而導致精液液化時間延長，這部分患者的治療要區分是附睪問題，還是前列腺的問題。一般前列腺出現問題的可能性偏大，部分患者需要補充相應的微量元素，部分患者是需要治療前列腺的相關炎症。前列腺炎更為複雜，分為有菌性前列腺炎和無菌性前列腺炎，不同的藥物或不同的病因，導致的結果和治療方案也是有點區別的。
精子質量差只是一個結果，是不同病因導致的，因此治療方式是不一樣的。如少精子症，部分患者是因為睪丸產生精子的能力質量異常，部分患者是因為輸精管道通暢性，還有患者是性生活的興奮程度射出來的精子數量少，不同的病因導致的結果可能是相同的。但是相同結果、病因不同 的情況下，治療原則也是不同的。精子數量少，主要是要分析是什麼病因，是需要生精，還是需要疏通生精的管道，不同病因的治療方案是不同的。一般來說，醫生很少會根據一張精液報告進行直接的治療，首先需要複查精液，核實完精子的質量確實是差，才做相應的病因分析，病因分析之後才做相應治療。
精液顏色發黃首先需要區分清楚，是禁慾時間太長還是感染引起的，這兩種情況都會導致精液顏色發黃。如果是禁慾時間太長，在體內儲留時間太長的情況下，顏色也會相應發黃。禁慾時間，如果控制在3-7天或者在10天以內的情況下，精液的顏色相對是灰白色，如果禁慾10天以上可導致 精液顏色發黃，不一定需要進行治療。此外還要觀察其他的伴隨症狀，有沒有尿頻、尿急、尿痛等，根據不同的情況具體分析。如果是感染原因引起的精液顏色發黃，一般來說，要分析精液裡面的炎症是哪種病原菌感染引起的，選擇針對性藥物進行治療，效果相對會比較好。
精子質量差是一個綜合參數，如精子數量少、精子活力差或者精子形態差。一般單純的精子活力少，中醫和西醫有兩種不同的理論，西醫理論認為精子的生成過程中出現問題，或者精子的儲存過程中出現問題。如果精子生成過程出現問題時，需要要改 善睪丸的生精環境。如果是精子的儲存環境出現問題，則要改善精子的儲存環境，也即是附睪，附睪的環境到底好不好，臨床上有相應的檢查或檢驗可以區分。如果是中醫的說法，有一句話叫做形不足者補之以氣，比如弱精症，一般來說採用補腎溫氣、補氣的治療方法，可以達到相應的治療效果。精子的活力差的具體程度也有區別，病因或治療也是有區別的。輕度弱精子症，一般來說是單純的生活習慣原因或外界環境原因，或者精子儲存環境出了問題，此類患者一般治療效果相對會比較好。如果是精子嚴重異常，用藥物治療效果可達到一定程度的改善。但是治療需設好治療目標，即是把精子活力盡量提升，從而有利於懷孕。
精子少的原因可從中醫和西醫兩個方面分析，具體內容如下：1、西醫：一般考慮睪丸產生精子的能力下降，或輸精管道不完全梗阻。如果是睪丸產生精子的能力下降的情況下，還要區分是營養不夠型還是營養過高型；如果體內激素水平達到一定值或者非常高的情況下，可能睪丸對這種營養的能力吸收偏差，此時再補充營養，效果比較差；如果是激素水平或營養水平不夠的情況下，通過補充營養或者單純的調理營養的吸收能力來配合治療，效果相對會比較好；2、中醫：考慮到睪丸的生精功能不足，中醫認為精不足者，溫之以腎，補之以味，即是說如果是少精症，多考慮是睪丸產生精子能力偏差，可採用溫腎、補腎填精的治療方法。
精子頭部缺陷，首先從常規形態學角度來說，精子頭部缺陷包含大頭、小頭、錐形頭、梨形頭、圓頭、不定形頭、有空泡的頭，頂體後區有空泡。以及頂體區域過小或過大，頂體區過小指頂體區小於整個精子頭部面積的40%。頂體區過大指頂體區域大於精子頭部整體面積的70%。雙頭、多頭以及缺陷的頂體組合，因為精 子頭部包含頂體酶和遺傳物質，所以如果精子頭部缺陷率過高，就會導致精子和卵子發生頂體反應時。由於酶缺陷或酶不夠，所以導致無法發生頂體反應，而出現精子和卵子不結合，也就是經常說的不受精，或由於頂體後區DNA物質受到影響，即使發生了頂體反應受精，受精後也無法形成胚子，或胚子形成之後，可能會導致胚胎不發育、胚胎髮育停滯或流產。一般情況下，一個精子和一個卵子結合，常規一份精液標本里面存在正常的精子比例非常多，所以畸形精子、頭部有缺陷的精子和正常精子相比，正常精子更容易和卵子結合。