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細菌性痢疾為感染性疾病，不建議將針灸治療作為細菌性痢疾的首選治療方案。細菌性痢疾明確診斷後，應早期、足量、足療程進行抗感染治療。若使用抗生素治療細菌性痢疾導致的腸道菌群失調，遷延不愈，可採用針灸治療，通過針刺足陽明胃經、 足太陰脾經的重要穴位，如足三里、三陰交、陰陵泉等穴位，調節腸道菌群，促進疾病康復。
細菌性痢疾主要是由於痢疾桿菌感染所引起的腸道傳染性疾病。細菌性痢疾發病率呈下降趨勢。目前細菌性痢疾在臨床上主要以抗生素治療為主，若患者出現發熱、腹痛、瀉痢膿血便等發病較急的症狀，應以西醫治療為主。若西醫治療效果不佳，可以考慮配 合針灸治療，針灸治療細菌性痢疾療效可靠、基本無副作用，可起到整體調節作用。
小兒痢疾是痢疾桿菌引起的急性消化系統傳染病，主要表現為高熱、腹痛、腹瀉、裡急後重、黏液膿血便等。嬰幼兒患有此病，可能由於腹痛引起頻繁哭鬧，也可因腹瀉次數增多引起肛周潮紅。症狀較輕者腹瀉次數較少，伴或不伴發熱；症狀較重者一天腹瀉十次以上，伴高熱、黏液膿血便。部分中毒性 痢疾是指在痢疾基礎上，出現中毒性腦病、脫水循環衰竭或其它併發症。治療主要有以下幾種方法：
白花蛇舌草，它是一個很好的解毒藥物。味苦、性寒，歸胃、大腸、小腸經，它的功能是清熱解毒，主治各種熱毒，包括肺熱喘渴、咽喉的腫痛、大腸膿毒、全身皮膚的疔瘡潰瘍等等。這個藥名中間有個“蛇”字，說明這個藥還可以治療毒蛇咬傷，對於痢疾、熱毒、黃疸都有非常好的效果。 另外，白花蛇舌草還有兩個比較特殊的功效：第一個是擅長治療多種腫瘤和癌症；第二個它有一定的消除蛋白的作用。根據現代藥理的研究，白花蛇舌草有四大功效，包括增強免疫力、抗腫瘤、抗蛇毒及殺菌的作用。
馬齒莧為馬齒莧科植物馬齒莧的全草。全草供藥用，有清熱解毒、散血消腫的功效。清熱、涼血，治療痢疾，主治熱毒、血痢，以及溼熱痢疾。馬齒莧能消除腹部包塊、止消渴、治療婦女赤白帶、消熱、解毒、消癰，可用於治火毒瘡瘍。馬齒莧酸寒，入心經走血分，功能涼血、止血，解毒、療癰，又入大腸又善 清、涼血、止痢，為血痢、瘡毒所常用。馬齒莧在臨床中主要作為外用的處方來使用，在皮膚病的處方中，佔量比重最大，用於治療溼疹、蕁麻疹等皮膚過敏症狀。在肛腸科的臨床處方中用於治療痔瘡以及肛瘻等症狀。它的使用是比較大的，在馬齒莧的臨床應用中主要還是謹遵醫囑，在內服的作用中，它的功效沒有外用的多，所以基本上不建議內服。