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新生兒敗血症是由於病原菌侵入到新生兒血液中，而且生長繁殖，產生毒素而造成全身性炎症反應，往往缺乏特異性臨床表現。但進展迅速，臨床中以3天為界，分為早髮型和晚髮型。早髮型指出生3天以內起病，感染因素多發生在出生前或出生時，往往病情較晚髮型敗 血癥更為嚴重。晚髮型敗血症指出生3天后起病，感染因素多發生在出生後，病死率較早髮型敗血症相對要低。
敗血症和菌血症的區別是敗血症病情嚴重程度重些，菌血症病情程度相對要輕。敗血症的概念在過去用的較多，現在多數用膿毒血癥代替敗血症。膿毒血癥一般在血裡可以檢測培養到細菌，還能檢測到它出現器官功能的改變，比如肝腎功 能的損害，出現全血細胞減少，甚至出現血壓下降。
新生兒敗血症通常治療時間為10-14天，並非所有的敗血症治療均有固定時間。新生兒敗血症是出現較為嚴重的感染後引起全身性的反應，由於感染原、治療藥物敏感性、自身抵抗能力不同，出現敗血症時使用的藥物不同，療程也會有所差異。較為常見的導致敗血 症的病原體為以下幾種：
敗血症實際是感染，即細菌進入到血液裡增殖，並引起一系列的感染表現。所以敗血症的患者往往會有高燒，血培養能夠培養出細菌。因為血液是營養豐富的培養基，細菌入血後會在血液裡大量增殖。隨著血流可以播散到全身的多個臟器和組織裡，可能會形成腦膿腫 或肝膿腫等一系列的問題，關鍵是要及早診斷明確。
敗血症經過有效治療一般不會復發。但是在一些特殊情況下，病原菌可能潛伏。在機體免疫低下時可能再次繁殖引起感染，但不一定出現敗血症，也可能是局部炎症反應，出現相應臨床表現。