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肝門膽管癌是臨床上相對較常見的惡性疾病，因為特殊位置導致手術也是具有很大特殊性，具體切除範圍需要看腫瘤侵犯範圍。根據腫瘤範圍不同，現在臨床上將肝門膽管癌分成四型，這是常採用的分型標準。較早期的腫瘤只是侵犯肝總管，手術只需要將肝總管部分的膽管切 掉，然後將淋巴結清掃乾淨。下一步就需要將下邊的空腸提上來和肝門部左右肝管做吻合，這樣就是把膽道引流重新建立起來。當然在切除腫瘤的時候，一般膽囊也要同時切掉。另外有一部分患者疾病進展較差，可能會侵犯左右肝管匯合位置，但只要沒有往左右肝管進一步侵犯，就和單純侵犯肝總管手術範圍相對差不多，也需要做局部膽囊切除、淋巴結清掃、膽腸吻合。假如腫瘤侵犯左邊或右邊膽管，這個時候單純切肝門部膽管不夠，還需要聯合半個肝臟切除和尾狀葉切除，再把剩下的一側肝管和空腸做吻合。還有最差的就是左右肝管都受累，這是手術當中最不希望遇到的情況，因為這種情況提示手術無法切除乾淨，只能做一些支架植入、外引流術等小手術，達到減輕黃疸，保證肝臟功能正常。
肝門部膽管癌手術能否成功，最主要的問題就是手術當中探查，能否將膽管切緣做到陰性，還有就是腫瘤是否侵犯血管，能不能夠把腫瘤完整的從血管分離，或聯合血管切除後將血管重新對接起來。再有就是如果需要切除肝臟，還需要看剩餘肝臟是否夠用 ，所以具體到每位患者，他的手術成功率很難斷定。一般來講在決定做手術前，都會做非常精細的評估，採取很多治療措施，一般決定去做手術，絕大部分至少應該有百分之五六十的手術成功把握。但也確實有少數的患者，有可能進到腹腔裡就發現有肝臟轉移，或腹腔種植轉移，這種情況基本上完全沒有辦法進行手術，只是做一個探查就結束了。還有少部分患者可能之前覺得應該有機會做手術，但是在手術的過程中發現沒有辦法徹底根治，手術也做到一半不能完全終止，這個時候有可能就是做姑息切除。手術是結束了，但並不是非常成功的腫瘤根治性手術。
絕大部分膽管癌的手術都需要切除部分膽管，然後將膽管和空腸進行吻合。手術後早期發熱的原因常見：1、手術區域的積液吸收導致發熱，這種發熱一般相對不會太高，病情較好控制；2、少部分患者可能會出現吻合口瘻，當出現這種情況的時候，患者 會出現腹膜炎的情況，這種感染相對較嚴重，這是較容易出現高熱的一種情況；3、部分患者在手術後遠期發燒，這種遠期的發燒絕大部分是因為反流性膽管炎引起。針對這種反流性膽管炎的原因大概有兩種情況：一種是因為腸道內容物反流到肝內膽管，反流進去以後向外排出不通暢，引起反覆發燒，並不與腫瘤相關，這是一種情況；還有一部分患者手術腫瘤切除不徹底，導致膽管吻合口處膽管腫瘤局部復發，復發腫瘤導致吻合口狹窄，這種情況患者特別容易出現腸內容物反流，且繼發感染不易控制的情況。
PTCD的中文全稱是經皮肝臟膽道穿刺引流置管術，主要是在彩超或者CT的引導下，通過特製的穿刺針穿刺到膽管裡面，進行膽汁的引流，主要是作用在一些惡性膽道腫瘤，比如肝門膽管癌、膽管下端癌，還有胰腺癌病人如果發生了遠處的轉移，或病人年齡比較大，身體條件 不好，不適合做大的手術，在這種情況下，需要進行膽道引流，改善黃疸的情況，降低黃疸的指數，對肝臟起到一個很好的保護作用。這種手術叫姑息性的膽道引流治療；還有一些病人，因為黃疸時間比較長，對凝血功能有影響，如果手術，凝血功能不好的病人在手術當中會發生大出血。術前做一個PTCD把黃疸降下來，這樣手術的安全性也會提高；另外還有一種就是病人發生了嚴重的膽道感染，發生感染性休克，這種情況下面，病人不適合做急症手術，也可以進行膽道引流，把感染的膽汁引出來，緩解感染症狀，等緩解以後，再進行第二步的手術治療。
PTCD穿刺治療一般不會引起腫瘤的擴散，因為PTCD主要是應用在膽管的腫瘤，膽管的腫瘤就分膽管的低位腫瘤、中段的腫瘤或膽管高位腫瘤，還有一種就是胰頭的腫瘤。這些腫瘤在穿刺的過程當中，穿刺的途徑都不會經過腫瘤，所以接觸不到，就不會發生腫瘤的播散、擴散。有些情況下面也有可能發生腫瘤的擴散，比如胰腺的腫瘤或膽管的腫瘤，但是主要是胰腺的腫瘤。發生了肝臟的轉移以後，肝臟裡邊很多轉移病灶，但是要通過肝臟穿刺到膽管裡面，所以在穿刺的過程中有可能碰到腫瘤，然後在穿刺的過程中引起一些播散。但是在彩超的引導下，選擇的穿刺途徑會盡量的避開肝臟的腫瘤病灶，以免發生轉移。
肝門膽管癌晚期的治療，以膽管引流，解除黃疸為主。因患者的膽道遭受阻塞，需運用引流法將梗阻解除，其治療方式有兩種，其一為通過膽道系統，經口腔放入十二指腸鏡，在膽管內放置塑料或金屬的支架，使膽汁能重新流入十二指腸，此種方法在醫學上稱為ERCP；另一種方法為PDCD，即通過肝 髒穿刺到膽管進行引流。兩種方式均能將膽汁通過梗阻部位引流出，達到降低黃疸的目的。