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隱睪手術後睪丸偏小，在青春發育期前一般不需要使用藥物促進睪丸發育。隱睪往往存在不同程度的睪丸發育不良，睪丸生殖細胞數目下降，因此睪丸較正常兒童小，等到青春發育期後大多數逐漸增大，但也會比正常兒童小。部分醫生對隱睪患兒會採用絨毛膜促性腺激素注射，促進睪丸發育，雖然會睪丸有所增大，但對側正常睪丸也可能受到損傷，導致正常睪丸生殖細胞早期凋亡，對以後的睪丸發育與生育都會造成不同程度的影響。只有以下兩種情況需要考慮採用激素進行治療：
隱睪切除手術需要0.5-2小時，不同患者的時間存在差異。隱睪切除分為腹股溝隱睪切除及腹腔內隱睪切除，若腹股溝隱睪能夠觸及，則手術時間較短，可以在15-30分鐘完成手術。但若隱睪位於高位，在腹腔內，通常需使用腹腔鏡進行尋找再進行切除。若隱睪位置明確，在腹腔鏡下進行手術，通常0.5-1小時即可完成。
通常患者僅存在單側隱睪，此時隱睪切除不影響性功能，而對側睪丸正常，能夠滿足男性日常的雄激素水平。但若切除雙側隱睪，由於雄激素水平不足，所以會影響性功能。若患者存在兩側隱睪，通常希望將低位隱睪進行下降、固定。而為避免發生腫瘤，需將高位隱睪切除， 保留一側睪丸釋放激素。
隱睪手術的最佳年齡是1-2歲，7歲隱睪患兒需行睪丸下降固定手術，若不進行手術治療，以後隱睪癌變機會將增加。臨床研究表明，位於腹腔的隱睪癌變率是正常情況的20倍，位於腹股溝的隱睪癌變率是正常情況的6-8倍，而位於陰囊高位，包括陰囊上極的隱睪癌變率是正常情況的2-3倍 。超過2歲的隱睪患兒生精上皮會發生一些不可逆損傷，發生不育症的幾率則會增加。