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正常兒童主動脈是由左心室發出，供應全身，肺動脈是由右心室發出，發出的肺動脈帶著全身回來的靜脈血到肺裡面進行氧合，所以主動脈裡的血是含有氧的到全身各個臟器和組織，而肺動脈的血是含氧比較低的，要回流到肺裡面進行氧合。而大動脈轉位 是由於肺動脈和主動脈發生錯位，主動脈發自於右心室供應全身，肺動脈發自於左心室，迴流到肺循環，這樣就會導致全身的各個臟器和組織，由含氧比較低的靜脈血供應，而肺裡面是含氧比較高的肺靜脈血，可使患兒出現全身嚴重缺氧，表現為青紫、嚴重的代謝性酸中毒，而合併有室間隔缺損的大動脈轉位還可出現很嚴重的肺動脈高壓。
正常孩子主動脈發自於左心室，冠狀動脈也位於從左心室發出來的主動脈上，肺動脈發自於右心室，而對於大動脈轉位的孩子來說，主動脈和肺動脈顛倒。主動脈起自於右心室，冠狀動脈位於從右心室發出的主動脈上，而肺動脈 起自於左心室。大動脈轉位要根據是不是合併室間隔缺損可以分為室間隔完整型大動脈轉位，和合併有室間隔缺損的大動脈轉位。大動脈轉位的手術對於室間隔完整型的大動脈轉位來說，要將主動脈和肺動脈進行移植對換，同時要將冠狀動脈從原來的主動脈上切下來，吻合到新生主動脈上，而對於合併室間隔缺損的大動脈轉位而言，除了要將肺動脈和主動脈重新顛倒吻合以外，還要做室間隔缺損的修補手術。因此，大動脈轉位手術由於手術操作牽涉到2個動脈的調轉和冠狀動脈的移植，所以手術難度比較大，手術風險相對較高。
完全性大動脈轉位屬於一類比較複雜的先天性心臟病，無論是手術風險和手術花費都很巨大，屬於先天性心臟病的一種。而目前對於先天性心臟病而言，沒有明確的發病原因。先天性心臟病的發生是由於胎兒時期心臟的發育過程中受到某些因素的 干擾，從而導致心臟的發育異常，導致一大類疾病，也包括大動脈轉位。目前發現的危險因素包括吸菸，包括二手菸，以及妊娠期血糖增高和病毒感染，接觸有毒的化學制劑等都是危險因素。而保護因素包括蔬菜攝入，維生素攝入，尤其是葉酸攝入和各種水果的攝入，都有利於預防先天性心臟病的發生。
完全性大動脈轉位手術由於手術難度比較大，手術風險比較高，所以一直是先天性心臟病外科界研究的重點和難點。由於這類手術，手術以後恢復了正常的循環關係和血流動力學關係，所以遠期預後還是比較好 的。但是遠期可能會存在問題，包括吻合口的狹窄和主動脈瓣的反流，這是由於新生的主動脈瓣在手術前是肺動脈瓣，而肺動脈瓣難以承受遠期的強大壓力，所以有一部分患者可能會出現新生的主動脈瓣的關閉不全。所以對於大動脈轉位手術過後的患者來說，患兒家長一定要記住，要定期給孩子做複查，門診隨訪，做超聲心動圖檢查，必要的時候還要做CT或導管檢查等，明確孩子是不是存在合併症。總體而言，手術效果是滿意的。