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卵巢囊腫手術之後可能會或多或少影響病人的月經情況，因為手術過程中對卵巢進行了程度不一、輕重不一的操作。而卵巢本身是內分泌器官，子宮內膜可能會有少許脫落，很多病人在經過卵巢囊腫手術之後，在當月可能出現月經提前或手術結束的幾天時間之內，可能會有一點月經流血，也屬於正常狀況。而比較嚴重的情況是在卵巢功能手術之後，病人月經稀發甚至停經，這種情況相對嚴重。因為卵巢囊腫手術，在去掉卵巢囊腫的過程中，實際上對卵巢本身可能會起到程度不一的破壞作用。
卵巢囊腫疼好還是不疼好這不能確定，因為不同患者的體質不同，囊腫大小不同出現的症狀也不同，如果小囊腫是沒有不適症狀，囊腫明顯增大會出現疼痛、出血等情況。如果患者對疼痛不敏感，也不會感覺到疼痛，需要去醫院進行B超檢查，根據囊腫大小選擇合適的治療方法。
卵巢囊腫不會引起閉經。卵巢囊腫分為兩種類型，生理性的卵巢囊腫和病理性的卵巢囊腫。因為每個月經週期，女性卵巢內卵泡都有一個卵泡逐漸的長大，長大成熟以後，這個卵泡就要破裂，破裂以後裡邊的卵子才能夠排出來。生理性的囊腫是卵泡長大後，卵泡無法破裂，卵子無法排出，所以卵子無法與精子結合，不能受孕。
在臨床上，卵巢囊腫會引起陰道不規則出血，究竟是卵巢囊腫的出血，還是月經來潮引起的陰道流血，是比較容易鑑別的。因為月經是規律性的，比如以往月經週期是28-30天，在原來的基礎上，如果提前3天或者推後3天，都屬於正常的，並且月經的量、月經的顏色，都跟以往的月經顏色、月經量是非常相近的，而且顏色是暗紅色的。