骨髓增生異常綜合徵（MDS）患者都有貧血症狀，如疲倦、乏力、面色蒼白。大部分患者有中性粒細胞減少，容易發生感染，常見的有呼吸道、消化道、泌尿系統感染等，患者可出現發熱、咳嗽、咳痰、腹瀉、尿頻、尿急、尿痛等症狀。約50%患者有血小板減少，可出現出血症狀，包括皮膚黏膜出血、牙齦出血、鼻出血、尿血、黑便等。部分患者可出現脾大。