幼年血清陰性脊柱關節病的主要症狀，是下肢腰疼或者是僵硬以及休息不能夠減輕，時間超過三個月，並且胸廓運動受限以及有下肢活動受限，包括胸部疼痛和僵硬的改變。明顯的雙側骶髂關節炎3-4級，其中以中軸關節病變為主。患兒初期會有發熱、運動障礙以及全身無力等一些全身性的症狀，通過臨床表現和輔助檢查能夠明確診斷。