禽流感的典型症狀主要有高熱、咳嗽、咳痰、咽痛、鼻塞、流涕、呼吸困難、頭痛、肌肉痠痛和全身不適等症狀，大約半數患者可以出現病毒性肺炎，可伴有胸腔積液。禽流感病死率較高，可以引起呼吸衰竭，值得重視。
人感染禽流感以後通常存在潛伏期，感染的亞型不同，潛伏期長短不一，通常起病比較急，症狀較輕者僅出現類似感冒的症狀。H5N1、H5N6和H7N9亞型最容易引起重症，病情進展迅速，患者可因此出現嚴重併發症而死亡。