1、病原學檢查：採用血膜染色鏡檢法，在患者外周血中檢出瘧原蟲是瘧疾確診的金標準。
2、循環抗原檢測：利用血清學方法檢測瘧原蟲抗原，快速試劑盒可在2~15分鐘得到結果。
3、循環抗體檢測：迄今為止所有實際應用瘧疾血清學試驗仍是基於瘧原蟲無性期抗體的檢測。瘧原蟲抗體在感染後2~3周出現，4~8周達高峰。
4、分子生物學檢測：採用PCR技術可檢測外周血中的瘧原蟲抗原基因片段
5、核酸探針檢測：具有獨特的高特異性，敏感性可高於鏡檢，可在短時間內成批處理大量樣本，已被認為可以定量及估算瘧原蟲血癥水平，是瘧疾流行病學調查及評價抗瘧措施效果很有潛力的診斷工具。