急性腸炎在臨床上經常與急性阿米巴痢疾和慢性非特異性潰瘍性結腸炎等有一定的相似性，所以需要鑑別。一、急性腸炎的患者主要是由於飲食不節制所引起的，一般的症狀主要是腹痛、腹瀉、嘔吐，一般會有食物中毒的疾病史。二、急性阿米巴痢疾的臨床表現一般起病比較緩慢，多數沒有發熱的情況，腹部疼痛也比較輕，沒有裡急後重的症狀，腹瀉的次數也是比較少的，一般會出現右下腹有壓痛感，大便的量比較多，常為暗紅色果醬樣的血便，並且白細胞比較少，紅細胞比較多，容易找到溶組織阿米巴滋養體。三、慢性非特異性潰瘍性結腸炎會反覆出現腹瀉和膿血便的情況，但是抗菌藥物沒有效果。