首先是每日飲水2000-3000mL，晝夜均勻，其次可以配合應用止疼藥物，例如雙氯芬酸鈉。可以減輕輸尿管的水腫，減少疼痛發作，促進結石排出。口服α受體阻滯劑例如坦索羅辛，可以起到使輸尿管下段平滑肌鬆弛的作用，促進結石的排出。
有一部分中醫中藥，例如尿石通、排石顆粒等，有清熱利溼、通淋排石的作用，佐以理氣活血、軟堅散結。有一些特殊成分的結石可以用溶石療法，例如尿酸結石和胱氨酸結石、尿酸結石可以口服別嘌呤醇、枸櫞酸氫鉀鈉、碳酸氫鈉等等，以鹼化尿液；胱氨酸結石可以口服枸櫞酸氫鉀鈉，或者碳酸氫鈉以鹼化尿液。要注意毒副作用還要配合適度的運動，通過這些方法綜合治療，才可能有利於腎結石排出。