一般來講，腎結石首先要看泌尿外科，因為泌尿外科能夠全面綜合的判斷腎結石是口服排石藥物配合多運動、多喝水即可，還是需要進行手術治療，大多數的腎結石都是可以通過輸尿管軟鏡、經皮腎鏡進行根治的。
一些特殊位置的腎結石可以不管，比如腎下盞小結石，沒有梗阻也沒有血尿等等。一些特殊類型的腎結石可以到內分泌科就診，比如頻繁發作、多發的、代謝性結石，最常見的就是痛風結石，常見於有痛風的患者腎內多髮結石，結石的性狀為尿酸結晶長期的蓄積引起的。如果手術做不了或者身體不好不能做手術，這時候可以到內分泌科進行就診，通過飲食藥物的調節，使這個結石逐漸變小甚至結石消失。