半夜2-3點鐘胃痛如果反覆發作，最先考慮的就是十二指腸球部潰瘍。因為胃酸在夜間沒有食物中和，可以刺激胃黏膜，對於十二指腸球潰瘍的患者就會出現夜間痛，進食以後有可能會明顯的改善。在這種情況下應該積極給予抑酸治療，比如運用質子泵抑制劑，如奧美拉唑、艾司奧美拉唑、雷貝拉唑、蘭索拉唑等這一類藥物。
如果當時疼痛比較厲害也可以給中和胃酸的藥，比如鋁碳酸鎂，可以快速的緩解症狀。但如果是十二指腸球潰瘍更需要明確原因，是否有進食一去痛片或者阿司匹林之類的藥物，是否存在幽門螺桿菌的感染。如果存在幽門螺桿菌的感染必須進行根除，一旦根除了幽門螺桿菌十二指腸球部潰瘍的複發率才能明顯的下降。