當子宮內膜異位到腹腔時會出現盆腹腔內的異位病灶，如卵巢巧克力囊腫。盆腹腔內的異位病灶也會隨著月經週期的變化而變化，如來月經時盆腔內出現異位內膜也會有出血，但由於血液排不出去機體又吸收不了，時間長了病灶可逐漸增大，易破裂，會造成急腹症引起盆腔組織間的粘連，如輸卵管與子宮粘連、與腸管粘連等等，從而可遺留盆腔粘連、痛經、卵巢功能減退、輸卵管不通等不孕症的病變。