羊水穿刺的目的是為了獲取羊水，並且利用羊水進行一些分析檢查的產前檢查方法，羊水檢查是採用了多種的實驗室技術，對羊水成分進行分析的產前辦法，羊水中的胎兒細胞可以用於細胞以及分子遺傳學的檢測，羊水中的酶學分析可以用於先天性遺傳代謝性疾病的篩查，羊水中的病原體的檢測將會有助於明確是否存在有宮內感染。
目前臨床上常常會用於羊水穿刺進行遺傳病的產前診斷，宮內感染病原體的檢測以及胎兒成熟度的判斷，在進行羊水穿刺的時候也會給一些局麻的藥物，而且不用過於緊張，羊水穿刺所帶來的疼痛，實際上這樣的羊水穿刺和平時進行肌肉注射的疼痛是一樣的，並不用給予過於關注和擔心。