羊水穿刺一般都沒有什麼副作用，極個別人可能會出現感染、胎膜早破甚至早產。做羊水穿刺結束後需要注意休息、定期產檢、注意胎動。一般都是在唐篩或無創DNA檢查是高風險的情況、或孕婦分娩過染色體異常的胎兒時才行羊水穿刺檢查，做羊水穿刺檢查會更準確。羊水穿刺檢查胎兒有嚴重的染色體異常時需要及時終止妊娠，否則生下來的寶寶就會有染色體疾病，這個疾病目前醫學還沒有辦法治療。