新生兒胎糞吸入綜合徵最危險的時期有兩個，分別是：第一、出生後半小時左右，此時胎糞堵塞寶寶氣管或者是支氣管，引起窒息、缺氧，如果不及時、不正確處理會因為缺氧而危及生命；第二、寶寶生後3-5天，此時寶寶雖渡過了胎糞的物理堵塞期，但是隨後繼發化學性損害、細菌感染可致胎糞吸入性肺炎、肺動脈高壓，加劇寶寶呼吸困難、缺氧而危及寶寶生命。