先天性巨結腸危害比較大，長期不治療會使患者營養不良，發育不佳，所以先天性巨結腸一旦診斷明確，在患者病情允許的情況下，同時在家屬有明確手術訴求的情況下，應該採用手術的方法治療。對於一些發病後沒有不適症狀或者症狀較輕的患者，做手術的時機需要根據病情等擇機進行。雖然明確診斷巨結腸，但由於症狀不重、腹脹不明顯，在採用輔助措施，如通過洗腸的方法、誘導的方法下大便還可以排出，同時家屬對手術也有一定的顧慮，此時可採用擇期手術的方式