椎間盤突出半夜疼醒是因為髓核突出壓迫比較重，或者肌肉勞損比較重，椎間盤突出伴有肌肉勞損和筋膜炎，白天勞累、受涼後夜間會出現銳痛、刺痛。這種情況需要暫時減少活動、臥床休息、熱敷，如果有鎮痛藥，可以用非甾體類消炎鎮痛藥物，比如扶他林、西樂葆，疼痛嚴重還可以用弱阿片類的曲馬多和阿片類的嗎啡，後兩種藥物需要在醫生的指導下應用。
鎮痛階梯性治療比較好，疼痛嚴重的時候，如果是髓核擠壓神經根造成水腫比較嚴重，可以用消腫的甘露醇、甘油果糖，還可以用少量激素，有利於消腫，緩解局部的劇痛。如果檢查發現髓核壓迫、粘連比較重或髓核比較巨大，擠壓神經根嚴重，這時手術治療比較好。