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兒童時期腮腺炎分為病毒和細菌感染引起，病毒感染比較常見，即流行性腮腺炎，具有傳染性，患兒常伴有發燒、頜下或耳後腫疼等，但多數患兒不會出現復發現象。容易復發的腮腺炎為細菌性腮腺炎，查體時 可以看到腮腺導管口處，有膿性分泌物以及膿液流出，用壓舌板刮、壓後，也能看到膿性的物質流出，其治療方法通常有以下幾種：
若患者由於腮腺炎導致無精子症，通常能夠治療，但治療較為困難。對於此類患者主要採取顯微取精手術，但治療的成功率較低。腮腺炎引起無精子症，屬於臨床較常見現象，即患者處於孩童時期出現腮腺炎，並且合併睪丸炎，造成局部生精功能嚴重下降， 使得生精小管受到損傷。隨著時間推移，病情難以得到恢復。
6歲腮腺炎兒童吃清熱解毒的中成藥即可，如常用藍芩口服液、蒲地藍消炎口服液、複方魚腥草口服液以及小兒熱速清顆粒等。小兒腮腺炎是病毒感染所導致的自限性疾病，目前沒有發現對腮腺炎病毒具有特異的抗病毒效果的藥物，如流感有奧司他韋這類抗流感的藥物。因此對於腮腺炎主要是對症處理，監測其併發症，可輔助使用清熱解毒的中成藥，幫助疾病的恢復並緩解症狀，局部不需要做特殊處理。
孩子腮腺炎反覆發作常見於細菌性、化膿性腮腺炎，通常情況下腮腺炎可分為流行性腮腺炎和細菌性腮腺炎。如果孩子腮腺炎反覆發作且不伴有其他身體不適，僅表現為腮腺導管發紅、發腫等局部炎症，在驗血時 白細胞多數情況下較高，則提示為細菌感染。多數由於口腔細菌逆行進入腮腺，在腮腺導管處造成阻塞，從而引起腮腺炎發生。此類細菌性腮腺炎不易根治且易反覆發作，但不會造成傳染。
通常認為在青春期後，即約16歲以後由腮腺炎引起睪丸炎，可能影響睪丸的功能。但目前並無明確的年齡界限，因為男性青春期的持續時間可能並不相同。一般是在睪丸正常發育後，如果患腮腺炎引發腮腺炎性睪丸炎，才可能影響睪丸功能。同時腮腺炎並非一定影響睪丸功能，需要腮腺炎累及睪丸，引起腮腺炎性睪丸炎，才可能導致睪丸萎縮，影響睪丸的神經功能，甚至導致無精子症的發生。