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肝內膽管細胞癌到了一定程度不適症狀是比較多的，比如疼痛，肝區或圍繞著肝區周圍的一些疼痛，還有發熱，有的發熱是高燒，有的是反覆的潮熱，還有的會出現黃疸，比較多的還會出現納呆、乏力、消瘦等等症狀。針對這些症狀，我們中醫藥可以通過辨證的方式給予分別的對症治療。比如黃疸，我們可以看它是陽黃和陰黃，分別採用茵陳蒿湯或者茵陳術附湯來進行治療。真正的膽管細胞癌引起的疼痛可以用一些中成藥，比如槐耳顆粒、小金丹、西黃膠囊、參一膠囊來進行針對性治療，也可以辨證使用大柴胡湯、柴胡疏肝散、烏梅湯等來進行辨證治療。病人出現消瘦乏力，往往可以採用疏肝理脾的方式，比如逍遙散、八珍湯等等來進行對症治療。對於出現其他的一些像溼熱內蘊，包括腹脹、腹痛、水腫，可以針對性的給予五苓散、豬苓湯等進行針對性治療。有的時候實際上是多法聯用，針對於虛實錯雜、寒熱夾雜的一些症狀和體徵，我們需要多箇中醫治法的綜合取效或者中藥的內服和外用，中藥和中成藥的聯合使用，這樣才能發揮更好的效果。
肝內膽管結石在我國屬於常見病和多發病，嚴重程度要根據具體情況而定。在醫院體檢時，很多時候並非肝內膽管結石，可能為肝內鈣化灶。結石一般位於膽管內部，而鈣化灶一般在管腔外面或肝實質間，是由於鈣鹽沉積導致，普遍存在於年輕人和老年人，無需特殊處理。通常可以通過肝膽B超、MRCP檢查明確診斷。
並非所有肝內膽管結石均需手術治療，大部分無需手術處理，除非引起反覆膽道梗阻、膽道感染，才需進行手術，若不手術則膽道梗阻不能解除，膽汁流不出，會形成結石。此外，反覆感染會引起發熱，甚至引起全身感染。膽管結石由於炎症反覆刺 激而導致肝內膽管癌變，如膽管細胞型肝癌，也建議積極手術治療。如果僅發現肝內膽管單髮結石，通常無需處理，也很難處理。
70%的人有肝內膽管結石的說法，可能統計數據不太準確，但是肝內膽管出現小結石或者鈣化灶的患者，發病率在人群中的確較高。此類患者大多數情況不需要進行任何的治療，即不太需要輸液、藥物治療或者手術治療，只需要定期觀察即可。
肝內膽管結石反覆發作40年，首選的治療方法是手術，通過術前的CT、核磁共振判斷後，儘量取淨結石。如果出現肝臟萎縮，可能還需要切除萎縮的肝臟。對於左肝外葉或者右肝後葉的結石，手術取淨結石具有一定難度，可能還需予以肝葉、肝段的切除，以達到取淨結石的目的，使病人獲得良好的治療效果。
多發肝內膽管結石指患者肝內膽管中結石數目多，可侷限在肝臟一段或者一葉，也可存在於整個肝臟，多侷限在左外葉、右後葉，患者可出現腹部疼痛、黃疸。長此以往會導致肝臟左外葉、右後葉萎縮，通常需要切除肝葉，如果不處理，萎縮的肝臟會癌變。
肝內膽管結石1cm，如患者無發熱、腹痛，B超和CT檢查未發現膽管擴張、腫塊、肝功能和腫瘤指標正常、無肝臟萎縮，則不需要進行任何處理。每年定期複查肝膽B超、CT、磁共振，以及肝功能、腫瘤指標，判斷有無膽管狹窄、肝臟萎縮、 癌變的可能，再考慮是否進行外科處理。
肝內膽管結石一般不會引起右上腹隱痛，右上腹隱痛常見於多髮結石造成的膽管堵塞或膽管狹窄、反覆膽道感染，同時還伴有畏寒、發熱。尤其肝內膽管結石掉入膽總管時，會誘發急性化膿性膽管炎，甚至引起 胰腺炎，疼痛非常劇烈。只有通過腹腔鏡手術或ERCP手術解除梗阻後疼痛才能緩解。