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腸道功能紊亂是較籠統的概念，腸道功能紊亂首先考慮的腸易激惹綜合徵和功能性消化不良，一般腸道功能紊亂，多數見於功能性疾病。腸易激惹綜合徵，主要是由於內臟敏感性動力異常或菌群失調，同時伴隨精神狀態抑鬱、焦慮、失眠，導致腹部不適、 腹痛、腹瀉，甚至大便習慣和性狀改變。經過生化或影像學檢測後，沒有器質性疾病，可明確為腸易激惹綜合徵。消化不良也是常見的致病因素，飲食不當導致產氣過多，或腸道菌群失調消化酶分泌不足，導致腸道功能紊亂。功能紊亂一般表現是腹痛、大便習慣或性狀改變，經過便常規、血象、生化檢測，沒有明確器質性疾病。一般基礎治療主要是調節腸道菌群，用益生菌調節腸道菌群和對症治療，包括用消化酶、胃腸道黏膜保護藥物，症狀一般都會緩解。
腸易激綜合徵指IBS，指反覆腹痛、腹脹、排便習慣改變為主要臨床表現的腸道功能性紊亂性疾病。在臨床上主要有四個類型，腹瀉型、便秘型、混合型和不確定型。在臨床上腹瀉型比較多，症狀主要就是大便次數少於每週3次，或者是多於每日3次。 大便的性狀比較堅硬，有的會出現水樣便或者是糊狀便。排便異常就是排便時費力，並且小便比較急，排便不乾淨、腹脹。這種情況在臨床上一般判定是腸易激綜合徵，這個疾病在臨床上非常常見的病因主要是有情志失調，飲食所傷，外感或者是臟腑虛弱等幾個方面。所以在臨床上可以藉助針灸穴位，達到調理臟腑虧虛或者是功能失常作用。在臨床上主要選取腹部的穴位，比如天樞穴、關元穴，還有可以選取下肢的穴位，如陰陵泉、三陰交、上巨虛、足三里，都可以達到健脾利溼、和胃止瀉的效果。
很多家長都會關注寶寶吐奶，特別是新手媽媽。新生兒時期，吐奶是比較常見的表現，特別是3個月以內的孩子。3個月以後或者吃正常輔食以後，小孩子吐奶的情況就會逐漸減少。由於小孩子的胃處於相對比較橫的位置，所以容易出現嘔吐、吐奶的情況 。吐奶的成分大部分都是胃內容物伴有少許奶瓣，因為胃液是酸性的物質，牛奶進入胃以後經過消化及部分酶的分解，會產生帶酸臭氣味的物質。一般情況下，吐一點酸臭味的奶，不一定是生病所致。許多家長認為寶寶吐奶可能是有消化道的問題。其實大部分情況下，嘔吐的東西都會帶有酸臭味。成人嘔吐出來的東西也會有酸臭味。
正常排便過程是大便初始時幹，後邊軟有點不成形。有些患者胃腸道功能或者動力出現問題，所以前邊特別幹、特別硬，但是後邊又會出現水樣便、糊狀便，這種叫便秘腹瀉混合型的功能性腸病。這種功能性腸病主要見於腸易激綜合徵，在排便之前 或者排便過程中，有腹部不舒服。腹痛、腹脹現象，排完便腹部症狀就可得到緩解。有時忍大便忍很久，比如1天沒大便、2天沒大便，大便前面就較幹較硬，這時腸道向外邊推大便的過程特別快，也會出現前邊幹後邊腹瀉的現象。所以大便前面幹後面稀有可能是正常的，也可能是功能性疾病。如果排便特別困難，困擾到生活、症狀反覆，要看醫生，排除器質性疾病。
腸易激綜合徵是臨床上常見消化系統疾病，最常見是腹痛型，其腹痛多有一定的誘因，如情緒激動、進食生冷食物、劇烈運動等，都可能導致腹痛的發生。其腹痛以臍周的痙攣性疼痛為主，誘因解除後可以自行緩解，但是一般反覆發作，病程較長。
腸易激綜合徵檢查方法很多，主要是要進行排除性診斷，排除胃腸道器質性病變。因為腸易激綜合徵是功能性疾病，即消化道心身疾病，因此通常需要進行腹部影像學檢查，如腹部B超、腹部CT、胃腸鏡檢查等，但是檢查結果通常沒有特殊的陽性發現。
腸易激綜合徵通常需要和腸道疾病或腸道外引起腹部症狀的疾病鑑別，主要鑑別的疾病為潰瘍性結腸炎，它們都有腹痛症狀，但是潰瘍性結腸炎在結腸鏡下會有明顯的腸道黏膜病變，如糜爛、潰瘍，一般可以通過腸鏡檢查鑑別。