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自身免疫性肝炎有不同階段，分肝炎階段、肝硬化階段。因為自身免疫性肝炎患者在肝炎階段多沒有任何不適，難以及早發現，所以患者就醫時大部分處於肝硬化階段，具體治療措施如下：
自身免疫性肝炎的診斷在免疫性肝病裡比較複雜。自身免疫性肝炎主要好發於女性，而且在輕度的時候，患者往往沒有任何的表現。很多病人是在體檢的時候發現轉氨酶升高，再做進一步檢查。此病主要是以轉氨酶升高、γ-球蛋白血癥和自身抗體陽性來進行診斷。此病 具體診斷步驟如下：1、患者如果有轉氨酶升高，ANA抗核抗體、抗線粒體抗體、抗平滑肌抗體、抗肝腎微粒體抗體陽性，則傾向於患者有自身免疫性肝炎；2、自身免疫性肝炎診斷的金標準其實是肝臟穿刺組織活檢術，即取一塊肝組織進行病理檢測，如果有淋巴細胞浸潤、玫瑰花環樣的特徵性病理表現，就可以明確診斷自身免疫性肝炎。一旦發現轉氨酶升高，且進一步檢查也不是傳染性肝病，如果考慮是免疫性肝病，自身抗體沒有陽性的表現，就要進行肝穿來確診，因為自身抗體的陽性率並不是很高。因此自身免疫性肝炎的診斷比較複雜，需一步一步的檢查，最主要的是檢查自身免疫性抗體的指標。
一旦確診為自身免疫性肝炎，患者一定要規律的在專科醫生指導下進行治療。自身免疫性肝炎有自己的特點，在活動期的時候肝臟炎症損傷進展得非常快，需規範化的治療。一旦確診為自身免疫性肝炎，就要進行免疫抑制治療，比如可用免疫抑制劑潑尼松龍、硫唑嘌呤，再加 熊去氧膽酸膠囊。
自身免疫性肝炎是一個免疫性疾病，因為免疫系統比較複雜，所以此病治療起來比較困難，不是特別好治。自身免疫性肝炎是免疫系統紊亂導致免疫系統攻擊肝細胞，現在西藥是通過應用糖皮質激素、免疫抑制劑來抑制免疫活動以達到控制肝臟損傷。但因為免疫抑制劑本身有 很多的副作用，所以很多病人都接受不了長期使用免疫抑制劑。因為長期使用免疫抑制劑也有副作用，所以此病治療起來相對比較困難和複雜。但如果是在規範化的指導下進行治療，病情還是能得到一定控制。
自身免疫性肝炎屬於自身免疫性疾病。形象的講就是人體自身免疫細胞，即人體自身的軍隊出現問題，好壞不分，把人體內正常的組織、細胞、器官當做敵人攻擊。也就是體內的體液免疫、細胞免疫不正常的識別、攻擊肝細胞，導致一部分正常的肝細胞死亡，雖然肝 細胞再生功能強，但其損傷達一定比例後，會表現出肝功能受損。總之，自身免疫性肝炎就是自身免疫系統發生問題，把肝臟當成敵人攻擊，從而產生的一系列病變。
自身免疫性肝炎是目前臨床上常見的一種疾病，也是發現率越來越高的疾病。但此種疾病沒有特殊的病因，因為是與免疫相關的疾病，大多數病因相對比較複雜。根據推測的原因，自身免疫性的肝病，可能會見到一些家族聚集現象，也就是患者的母親有此種疾病，其女兒也會有此 疾病。所以一般認為遺傳易感是對於此種疾病具有一定的意義。另外一方面，往往是有一種免疫性肝病的基礎，常常會見到自身免疫性肝炎患者，會合併有乾燥綜合徵，也就是常見的口乾、眼乾和鼻子乾的表現。化驗相關抗體是呈陽性，而且會伴有風溼性的關節炎和一些潰瘍性結腸炎等疾病。所以總體來講，病因是非常不明確。
自身免疫性肝炎檢查，目前主要通過手段，首先是檢查抗體，現在做的比較多的抗體，比如抗核抗體、抗平滑肌抗體、抗線粒體抗體、抗線粒體抗體的M2亞型、抗肝腎微粒體抗體、抗可溶性肝抗原抗體，甚至是檢查ANCA抗體，然後ANCA抗體又分為P-ANCA和C-ANCA，都是抗體的血液檢測。所以臨床上會有一個自 免肝的抗體譜，是由血液進行診斷，目前診斷價值比較有限，並不是所有的自身免疫性肝炎患者都會有抗體的陽性。其次，肝穿對於自身免疫性肝炎意義更大，也就是在B超的定位下，從肝臟取一塊組織出來，在顯微鏡底下根據肝臟的炎症特徵，比如界面性的肝炎、玫瑰花結表現，淋巴細胞的聚集情況進行定義。根據經驗對於自身免疫性肝炎，肝穿刺活檢意義更大。如果沒有肝穿刺活檢，則不能隨便使用激素，因為自身免疫性肝炎標準的治療是激素治療或者是免疫抑制劑的治療。所以臨床上如果懷疑自身免疫性肝炎，建議患者進行肝穿刺活檢。肝穿刺活檢並沒有患者所想象的可怕，現在也是非常成熟的一種手段。
嚴格來講，自身免疫性肝炎具有遺傳易感性，和家族存在一定的關係。但是自身免疫性肝炎並不是在染色體裡面攜帶，所以屬於是不遺傳的疾病，只是會有家族聚集現象。對於此類疾病，目前病因尚不清楚，但是不能因為存在家族聚集現象就認為是遺傳性的疾病。自身 免疫性肝病往往會見到自身免疫性肝炎，會有家族裡同時數人得病，此種情況下，如果發現有人患病，建議家屬尤其是直系的女性家屬進行自免肝相關的檢測，如果沒有問題最好不過，如果存在問題可能需要進行治療。因為自免肝的治療比較難治，使用標準的治療，需要激素和免疫抑制劑的治療，而激素和免疫抑制劑對身體的危害相對比較嚴重，所以診斷清楚就顯得格外重要。而診斷的前提，家族聚集的遺傳易感性是有一定的提示意義，但是不能提示自身免疫性肝炎就是遺傳代謝性的疾病，並不就是家族遺傳。
自身免疫性肝炎，因為目前病因不明，相對診斷亦是比較困難，需要病理學的診斷，就是在肝組織活檢裡邊取1塊肝組織到顯微鏡下，根據自身免疫性肝炎的表現進行確診。所以相對治療並沒有特別較好的辦法，嚴格意義來講，並不能徹底治癒。目前臨床上所使用的標準治療是激素加上免疫抑制劑，比如硫唑嘌呤類藥物。此類藥對身體損傷也是比較嚴重，而且自身免疫性肝炎治療是長期的過程，經過3-5年的治療之後，又進行第2次的肝穿，發現患者肝臟的炎症已經緩解，此時才有停藥的指徵。
嚴格的講，因為自身免疫性肝炎原因不明，所以沒有特別好的預防手段，但是目前發現如果患有自身免疫性其它的疾病，比如潰瘍性結腸炎、紅斑狼瘡、硬皮病、乾燥綜合徵或者相關的疾病，則容易會有在肝臟的表現。特別是現在已經發現乾燥綜合徵、原發性膽汁性膽管炎和潰瘍性結腸炎 的關聯性特別強。所以如果有其它免疫性疾病的患者，建議定期檢查肝功能，甚至需要定期查看自免肝的抗體譜是有一定意義，因為臨床上既往沒有自身免疫性肝炎，但是隨著使用某些藥物或者是治療其它疾病，而相應藥物或者疾病，就會導致身體產生自身免疫性肝炎，也稱為藥物誘發的自身免疫性肝炎，相對治療會是不同。自身免疫性肝炎需要長期使用激素及免疫抑制劑治療的疾病，但是如果是藥物誘發的自身免疫性肝炎，其預後則相對比較好，使用激素和免疫抑制劑治療也是同樣的方法，同樣的藥物，但是療程相對較短，存在有停藥的機會，所以一定要引起注意。
自身免疫性肝炎是一種自身免疫性疾病，是由於機體產生的一種自身抗體對肝細胞造成損傷。給自身免疫性肝炎病人做肝穿，會在肝穿病理切片上表現為明顯的界面炎，肝細胞腫脹、壞死，甚至肝小葉改變、假小葉形成。自身免疫性肝炎主要和肝自身免疫紊亂有關係，使 自身抗體破壞正常的肝細胞所形成的肝炎，所以自身免疫性肝炎一般沒有傳染性，但是它表現出來的臨床表現和其它肝炎一樣，表現為轉氨酶升高，甚至是皮膚與鞏膜黃染、尿黃，全身乏力。自身免疫性肝炎的治療，主要是激素和免疫抑制劑。
自身免疫性肝炎主要是由於自身抗體產生造成的肝細胞水腫、壞死、肝小葉破壞，所以實驗室表現為轉氨酶升高，谷丙轉氨酶、穀草轉氨酶升高，膽紅素表現為總膽紅素、直接膽紅素、間接膽紅素升高，一個肝細胞性黃疸。如果自身免疫性肝炎侵犯膽管上皮細胞，還會表現為鹼性 磷酸酶和γ-GT升高。自身免疫性肝炎和其它肝炎臨床表現相近，主要是乏力、低熱、右上腹脹痛、不適、厭油、噁心、嘔吐、尿黃表現，如果不及時治療，病人就會轉成慢性，症狀會長期持續2個月、3個月，甚至4-5年時間，一直進展到肝硬化、肝功能衰竭，出現肝功能衰竭表現，對雌激素滅活也會發生異常，表現為上腔靜脈區域，比如前胸、手掌出現蜘蛛痣。
自身免疫性肝炎是由於自身免疫反應引起，這種自身免疫反應實際是自身免疫功能紊亂所造成的自身抗體對自身肝細胞破壞，所以治療要用到免疫抑制劑和激素。自身免疫性肝炎在急性期，最常用的治療是強的松，每天40-60mg，持續應用10天時間，如果要肝功能有好轉，10天以 後將強的松減到30mg每天，同時加用硫唑嘌呤，硫唑嘌呤是一種免疫抑制劑，長期應用硫唑嘌呤要監測血常規和骨髓造血功能，所以吃硫唑嘌呤的病人常規在吃藥以前做骨髓穿刺。硫唑嘌呤和激素應用每10天強的松減10mg，硫唑嘌呤加30-40mg，最合適的一個治療方法就是強的松10-20mg，硫唑嘌呤100mg，這樣既減少激素應用，又避免硫唑嘌呤免疫抑制副作用，所以要長期維持，有的病人要維持3-5年，一直到肝臟病理正常為止。
自身免疫性肝炎是自身免疫功能紊亂引起來的肝細胞損害，臨床表現和其他病毒性肝炎相類似，比如乏力、厭油膩、黃疸、鞏膜、皮膚黃染、尿黃，和甲型病毒性肝炎、乙型病毒性肝炎，甚至戊型病毒性肝炎臨床表現一樣。