有牙周炎的人可以使用衝牙器，牙周炎的患者會發生牙槽骨的吸收、牙齦退縮等，使相鄰兩牙之間縫隙增大，容易嵌塞食物殘渣和軟垢，普通的刷牙只能去除牙齒唇面、舌面、頜面等80%左右的軟垢和殘渣，必須藉助牙線、牙間隙刷、衝牙器等，才能更有效的達到清潔目的。

衝牙器加壓沖洗時可以沖掉牙間隙中滯留的食物軟垢和牙菌斑等，並將細菌沖洗排出到口外，避免了食物殘渣壓迫牙齦後導致牙齦炎症等後果。