牙周炎患者洗牙有疼痛感，牙周健康的牙齒進行超聲波潔治時高頻震盪會引起牙齒痠疼，能夠忍受，手動刮除齦下結石時會刺激牙周軟組織，引起疼痛。

患有牙周炎時牙面上的大塊結石及齦下結石會刺激牙槽骨發生進行性吸收，牙齦萎縮後暴露牙頸部和牙根面，這兩個部位的牙骨質和牙釉質較薄，接觸超聲波潔治器時會產生明顯的痠疼，有時為了治療需要進行局部麻醉，才能徹底清除結石、病變骨質等。