目前鼻息肉手術通常在鼻竇內窺鏡下進行，由於需經過鼻腔途徑，在手術過程中痛苦比較明顯。為減少痛苦，通常在全麻下進行手術，部分醫院可能通過局麻進行比較簡單的手術，但痛苦均在可接受範圍。

全麻後手術因為在麻醉狀態，患者無知覺，送回病房完全清醒時，鼻腔可能處於填塞狀態。一般填塞需經過48個小時，在此期間填塞所引起的鼻腔內不通氣以及脹痛感，大於手術本身引起的疼痛感。所以多數患者自覺進行鼻息肉手術後，不能接受填塞物帶來的異常感覺。