胃與食管連接部醫學上稱為賁門，正常情況具有閥門作用，可阻止胃內容物反流入食管。如果閥門遭到破壞可以引起反流，主要原因包括以下幾點：

1、最常見原因是隨年齡增長，賁門部括約肌機能退化，因此胃食管反流隨年齡增長發生率增加；

2、不良生活習慣，如吸菸、飲酒、進食辛辣刺激性食物等會導致賁門部括約肌功能下降；

3、肥胖等腹內壓增高因素以及某些藥物，也是引起反流的原因；

4、食管裂孔疝在導致胃食管反流中也起到一定作用，大部分胃食管反流病患者往往合併食管裂孔疝。