目前臨床治療主要從兩方面入手，一是採用內鏡下氬氣的治療，可以對黏膜進行氬氣燒灼，以達到治療食道炎症的目的。二是如果病情更為嚴重，可以採用內鏡下手術，對食道黏膜進行剝離，可以更有效地治療食道炎症。

巴雷特食管指食管下段的黏膜被胃內黏膜所代替，是食管癌的癌前疾病，具有一定風險性。巴雷特食管的治療方案應根據具體表現而定，如果只是巴雷特食管，內鏡檢查沒有發現炎症，或活檢之後並沒有嚴重的病理表現，則可繼續觀察，採取對症治療。如果在內鏡下已經發現食道中存在炎症，則提示癌變的風險較高，應及時採取治療。