Barrett食管可以根治，一般通過內鏡治療和手術治療就可以達到治癒目的。但並不是一旦診斷為Barrett食管，都需要進行內鏡和手術治療。我國Barrett食管癌變率在0.61%左右，所以一般Barrett食管症狀比較輕，病理類型不伴有異型增生的，首先建議生活方式干預、藥物治療，儘量把症狀減少，然後定期複查。

如果Barrett食管病理提示有低級別或高級別上皮內瘤變，建議內鏡下切除或內鏡下射頻消融，除內鏡治療以外，部分需要手術治療。綜上，Barrett食管只有發生了異型增生，手術治療和內鏡治療才算根治，但不是所有的Barrett食管都需要進行根治。