治療食管平滑肌瘤的微創方法是在胃鏡下將腫瘤完全切除，這種方法安全有效。對位於食管黏膜層的較小平滑肌瘤，可以直接在內鏡下剝除後關閉創面，較大的平滑肌瘤可以在內鏡下建立隧道，完整剝離腫瘤後再將腫瘤經口腔取出，術後將隧道口關閉。患者術後1-2天可以活動和進食，恢復快，無副作用。

若為直徑超過5cm，形態不規則的平滑肌瘤，術前需要進行詳細檢查，準確判斷是否適合內鏡下治療。多數患者可以應用內鏡下治療，少數患者需要與胸外科醫生共同討論手術方案。部分患者可以採用胸腔鏡下微創治療，針對不同部位、不同形態、不同大小的食管平滑肌瘤，採取個體化微創手術治療，以達到最安全、最有效的治療目的。