乙肝疫苗的全程注射，通常是按照016的方法進行，即0個月、1個月、6個月，因此第三針的注射時間，需要從第一針接種往後推6個月去接種。但如果期間出現發燒、感冒，或其他不適，可以適當往後延長。通常對於處在疾病急性期的患者，不建議做疫苗注射，但需要注意儘量避免提前，以及往後延長太久。

因此乙肝疫苗的第三針注射，應該是與第一針大概間隔6個月的時間。第三針乙肝疫苗完成後，即患者全程的乙肝疫苗完成接種後，到第7個月的時候，便可以查乙肝5項，觀察是否出現有效免疫，即觀察表面抗體滴度是否達到範圍。如果在100mIU/ml以上，甚至更高水平，例如＞1000mIU/ml，便屬於成功的疫苗接種。