因為乙肝病毒一般難以被清除，所以乙肝談不上能夠徹底治癒。一般乙肝患者經過治經過抗病毒治療之後，如果乙肝表面抗原消失，甚至是同時伴有表面抗體的產生，此時稱為臨床治癒，也就是乙肝病毒可能已經清除。

部分病毒感染可能是自限性疾病，如感冒、流感，可能1-2周的時間病毒會自行清除，還有戊肝、甲肝，病毒也可以清除和消失，因此可以治癒。但是對於乙肝，不能完全被清雖然除，但現在有核苷酸類似物、核苷類似物、干擾素等，有不同的組合方式，因此爭取能夠使患者達到表面抗原消失，從而達到疾病的臨床治癒。