矯正牙齒和牙齦萎縮沒有因果關係。牙齦萎縮即牙齦退縮，從專業分類而言，牙齦萎縮屬於牙周病的一種類型，牙周病可能是因為前期口腔衛生不良，牙齒軟垢下留存的細菌產酸，導致牙齦軟組織及牙槽骨的吸收，從而出現牙齦萎縮的情況。

如果矯正前有牙齦萎縮的情況，正畸科需要和牙周科進行密切的會診合作，牙周科醫生通過牙周的系統治療，在患者的牙齦萎縮得到緩解後開始進行正畸治療。在正畸治療的過程中，患者每3-6個月需要去牙周科檢查牙周的情況，是否能維持正常的牙周狀況。如果牙周出現異常，則隨時到醫院進行牙周的系統治療。