1、體格檢查：判斷有無腹部壓痛、腹部緊張度，腸鳴音是否亢進。

2、實驗室檢查：

（1）糞便檢查：包括大便外觀、鏡檢、培養等。大便常規(紅/白細胞、原蟲、蟲卵、脂肪滴)檢查、潛血試驗、糞便培養、糞便脂肪定性檢測(蘇丹Ⅲ染色)、大便電解質或pH檢測等檢查均有益於病因學的判斷。

（2）血液生化檢查：包括血常規、電解質、血清總蛋白、C反應蛋白、紅細胞沉降率，可以瞭解患者感染病原菌情況，有無貧血等表現。

3、影像學檢查：

（1）X線鋇餐或鋇劑灌腸：觀察全胃腸道的功能狀態，初步判斷有無器質性病變。

（2）結腸鏡檢查：可進入末段迴腸，直接觀察結腸黏膜，必要時可行組織活檢。

（3）小腸鏡檢查：在懷疑或需排除小腸病變的情況時可予選擇。

（4）膠囊內鏡：為胃腸道檢查提供了無創性方法，但不能重複觀察，且不能設置觀察重點。