病毒性心肌炎一般是自身免疫性疾病，可以自愈。即輕度心肌炎可以通過休息、清淡飲食，經過1個月左右，可以自愈。對於嚴重心肌炎，要對症治療。

如果心肌炎合併有心律失常，如頻發室性早搏、房性早搏，進行抗心律失常治療。如果合並發展成為心肌病，要進行抗心衰治療，在營養心肌同時，要用強心、利尿的藥物進行抗心衰治療。

在心肌炎的後期，還要進行心臟康復治療，所以要進行適當鍛鍊，用提高免疫力的藥物和改善能量代謝的藥物，如輔酶Q10、1,6-二磷酸果糖，以及中藥玉丹榮心滴丸等。病毒性心肌炎一般兒童比較常見。所以在臨床中中藥治療非常有效，可以進行益氣養陰、抗病毒、抗感染治療。